Laboratoire d'Informatique Médicale et d'Ingénierie des Connaissances en e-Santé

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Publications

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Publications de CHARLET Jean
Publications de type "Article indexé"
2017
1. Dhombres F, Maurice P, Friszer S, Guilbaud L, Lelong N, Khoshnood B, Charlet J, Perrot N, Jauniaux E, Jurkovic D et al. "Developing a knowledge base to support the annotation of ultrasound images of ectopic pregnancy." Journal of biomedical semantics 2017 8:4
2016
2. Soualmia LF, Charlet J "Efficient Results in Semantic Interoperability for Health Care. Findings from the Section on Knowledge Representation and Management." Yearbook of medical informatics 2016 184-187
3. Aimé X, Charlet J "Social psychology insights into ontology engineering." Future Generation Comp. Syst. 2016 54:348-351
4. Jaulent MC, Leprovost D, Charlet J, Choquet R "Semantic interoperability challenges to process large amount of data perspectives in forensic and legal medicine" Journal of Forensic and Legal Medicine 2016
2015
5. Charlet J, Darmoni SJ "Knowledge Representation and Management. From Ontology to Annotation. Findings from the Yearbook 2015 Section on Knowledge Representation and Management." Yearbook of medical informatics 2015 10:134-6
6. Aimé X, Charlet J, Maillet D, Belin C "[Artificial intelligence meeting neuropsychology. Semantic memory in normal and pathological aging]." Geriatrie et psychologie neuropsychiatrie du vieillissement 2015 13:88-96
7. Aimé X, Traoré L, Chniti A, Sadou E, Ouagne D, Charlet J, Jaulent MC, Darmoni S, Griffon N, Amardeilh F et al. "Semantic interoperability platform for Healthcare Information Exchange" IRBM 2015 in press
8. Richard M, Aimé X, Krebs MO, Charlet J "Enrich classifications in psychiatry with textual data: an ontology for psychiatry including social concepts." Studies in health technology and informatics 2015 210:221-3
9. Toubiana L, Ugon A, Giavarini A, Riquier J, Charlet J, Jeunemaitre X, Plouin PF, Jaulent MC "A "pivot" Model to set up Large Scale Rare Diseases Information Systems: Application to the Fibromuscular Dysplasia Registry." Studies in health technology and informatics 2015 210:887-91
2014
10. Griffon N, Charlet J, Darmoni SJ "Managing free text for secondary use of health data." Yearbook of medical informatics 2014 9:167-9
11. Charlet J, Szemes M, Malik KT, Brown KW "MYCN is recruited to the RASSF1A promoter but is not critical for DNA hypermethylation in neuroblastoma." Molecular carcinogenesis 2014 53:413-20
12. Charlet J, Mazuel L, Declerck G, Miroux P, Gayet P "Describing localized diseases in medical ontology: an FMA-based algorithm." Studies in health technology and informatics 2014 205:1023-7
13. Declerck G, Baneyx A, Aimé X, Charlet J "Les ontologies fondationnelles peuvent-elles débabeliser le web ?" Revue d'Intelligence Artificielle 2014 28:191-216
14. Parès Y, Aimé X, Charlet J, Jaulent MC "Towards an automatic harmonization of the representation of medical reports to assess their similarities." Studies in health technology and informatics 2014 205:858-62
15. Daniel C, Sinaci A, Ouagne D, Sadou E, Declerck G, Kalra D, Charlet J, Forsberg K, Bain L, Mead C et al. "Standard-based EHR-enabled applications for clinical research and patient safety: CDISC - IHE QRPH - EHR4CR & SALUS collaboration." AMIA Joint Summits on Translational Science proceedings. AMIA Joint Summits on Translational Science 2014 2014:19-25
2013
16. Vandenbussche PY, Cormont S, André C, Daniel C, Delahousse J, Charlet J, Lepage E "Implementation and management of a biomedical observation dictionary in a large healthcare information system." Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA 2013 20:940-6
17. Grosjean J, Merabti T, Soualmia LF, Letord C, Charlet J, Robinson PN, Darmoni SJ "Integrating the human phenotype ontology into HeTOP terminology-ontology server." Studies in health technology and informatics 2013 192:961
18. Griffon N, Charlet J, Darmoni S, Section Editors for the IMIA Yearbook 2013, Section on Knowledge Representation and Management "Knowledge representation and management: towards an integration of a semantic web in daily health practice." Yearbook of medical informatics 2013 8:155-8
19. Assélé Kama A, Choquet R, Mels G, Daniel C, Charlet J, Jaulent MC "An ontological approach for the exploitation of clinical data." Studies in health technology and informatics 2013 192:142-6
20. Choquet R, Kama AA, Charlet J, Jaulent MC "Solutions d'interopérabilité sémantique pour la surveillance de l'antibiorésistance en Europe." Ingénierie des Systèmes d'Information 2013 18:59-82
2012
21. Chniti A, Boussadi A, Degoulet P, Albert P, Charlet J "Pharmaceutical validation of medication orders using an OWL Ontology and Business Rules." Studies in health technology and informatics 2012 180:1224-6
22. Aimé X, Charlet J, Furst F, Kuntz P, Trichet F, Dhombres F "Rare diseases knowledge management: the contribution of proximity measurements in OntoOrpha and OMIM." Studies in health technology and informatics 2012 180:88-92
2011
23. Declerck G, Charlet J "Intelligence Artificielle, ontologies et connaissances en médecine. Les limites de la mécanisation de la pensée" Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série RIA : Revue d'Intelligence Artificielle 2011 25:445-472
24. Cormont S, Vandenbussche PY, Buemi A, Delahousse J, Lepage E, Charlet J "Implementation of a platform dedicated to the biomedical analysis terminologies management." AMIA ... Annual Symposium proceedings. AMIA Symposium 2011 2011:1418-27
2010
25. Blanc FX, Baneyx A, Charlet J, Housset B "[Representation of knowledge in respiratory medicine: ontology should help the coding process]." Revue des maladies respiratoires 2010 27:741-50
2009
26. Daniel C, Buemi A, Mazuel L, Ouagne D, Charlet J "Functional requirements of terminology services for coupling interface terminologies to reference terminologies." Studies in health technology and informatics 2009 150:205-9
27. Charlet J, Baneyx A, Steichen O, Alecu I, Bozec CDL, Bousquet C, Jaulent MC "Utiliser et construire des ontologies en médecine. Le primat de la terminologie." Technique et Science Informatiques 2009 28:145-171
2008
28. Baneyx A, Charlet J "OntoPneumo - An ontology of pneumology domain." Applied Ontology 2008 3:229-233
2007
29. Bricon-Souf N, Bringay S, Hamek S, Anceaux F, Barry C, Charlet J "Informal notes to support the asynchronous collaborative activities." International journal of medical informatics 2007 76 Suppl 3:S342-8
30. Steichen O, Rossignol P, Daniel-Lebozec C, Charlet J, Jaulent MC, Degoulet P "Maintenance of a computerized medical record form." AMIA ... Annual Symposium proceedings. AMIA Symposium 2007 691-5
31. Baneyx A, Charlet J, Jaulent MC "Building an ontology of pulmonary diseases with natural language processing tools using textual corpora." International journal of medical informatics 2007 76:208-15
2006
32. Charlet J, Bachimont B, Jaulent MC "Building medical ontologies by terminology extraction from texts: an experiment for the intensive care units." Computers in biology and medicine 2006 36:857-70
33. Bricon-Souf N, Bringay S, Anceaux F, Hamek S, Degardin N, Barry C, Charlet J "A study of the communication notes for two asynchronous collaborative activities." Studies in health technology and informatics 2006 124:713-8
34. Baneyx A, Charlet J, Jaulent MC "Methodology to build medical ontology from textual resources." AMIA ... Annual Symposium proceedings. AMIA Symposium 2006 21-5
35. Steichen O, Daniel-Lebozec C, Charlet J, Jaulent MC "Use of electronic health records to evaluate practice individualization." AMIA ... Annual Symposium proceedings. AMIA Symposium 2006 1110
36. Bringay S, Barry C, Charlet J "Annotations for the collaboration of the health professionals." AMIA ... Annual Symposium proceedings. AMIA Symposium 2006 91-5
2005
37. Baneyx A, Charlet J, Jaulent MC "Building medical ontologies based on terminology extraction from texts: an experimentation in pneumology." Studies in health technology and informatics 2005 116:659-64
2004
38. Bringay S, Barry C, Charlet J "Les documents et les annotations du dossier patient hospitalier" Revue I3 - Information Interaction Intelligence 2004 4
39. Salaün JM, Charlet J "Introduction : un dialogue pluridisciplinaire pour penser le « document numérique »" Revue I3 - Information Interaction Intelligence 2004 4
40. Bourigault D, Aussenac-Gilles N, Charlet J "Construction de ressources terminologiques ou ontologiques à partir de textes Un cadre unificateur pour trois études de cas." Revue d'Intelligence Artificielle 2004 18:87-110
2002
41. Le Moigno S, Charlet J, Bourigault D, Degoulet P, Jaulent MC "Terminology extraction from text to build an ontology in surgical intensive care." Proceedings. AMIA Symposium 2002 430-4
1998
42. Zweigenbaum P, Bouaud J, Bachimont B, Charlet J, Séroussi B, Boisvieux JF "From text to knowledge: a unifying document-centered view of analyzed medical language." Methods of information in medicine 1998 37:384-93
43. Charlet J, Bachimont B, Brunie V, el Kassar S, Zweigenbaum P, Boisvieux JF "Hospitexte: towards a document-based hypertextual electronic medical record." Proceedings. AMIA Symposium 1998 713-7
44. Haouche-Gingins C, Charlet J "A knowledge-level testing method." Int. J. Hum.-Comput. Stud. 1998 49:1-20
1997
45. Zweigenbaum P, Bouaud J, Bachimont B, Charlet J, Boisvieux JF "Evaluating a normalized conceptual representation produced from natural language patient discharge summaries." Proceedings : a conference of the American Medical Informatics Association. AMIA Fall Symposium 1997 590-4
1996
46. Charlet J, Reynaud C, Krivine JP "Causal model-based knowledge acquisition tools - discussion of experiments." Int. J. Hum.-Comput. Stud. 1996 44:629-652
1995
47. Zweigenbaum P, Bachimont B, Bouaud J, Charlet J, Boisvieux JF "Issues in the structuring and acquisition of an ontology for medical language understanding." Methods of information in medicine 1995 34:15-24
48. Zweigenbaum P, Bachimont B, Bouaud J, Charlet J, Boisvieux JF "A multi-lingual architecture for building a normalised conceptual representation from medical language." Proceedings. Symposium on Computer Applications in Medical Care 1995 357-61
Publications de type "Communication dans un congrès"
2015
49. Richard M, Aimé X, Krebs MO, Charlet J "LOVMI : vers une méthode interactive pour la validation d'ontologies" 2015 26es journées francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC) Rennes France
50. Ranwez S, Sébastien H, Charlet J, Le P, Jean P, Menager MT "OntoToxNuc : exploitation d’une ontologie de la toxicologie nucléaire environnementale dans une plateforme collaborative" 2015 SIIM Rennes France
51. Toubiana L, Ugon A, Giavarini A, Riquier J, Charlet J, Jeunemaitre X, Plouin PF, Jaulent MC "A “pivot” Model to set up Large Scale Rare Diseases Information Systems: Application to the Fibromuscular Dysplasia Registry" 2015 MIE2015 The 26th International Congress of the European Federation for Medical Informatics Madrid Spain
2014
52. Charlet J, Mazuel L, Declerck G, Miroux P, Gayet P "Décrire les maladies localisées et la physiopathologie pour une ontologie des urgences : un algorithme générique à partir de la FMA" 2014 15-26 IC - 25èmes Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances Clermont-Ferrand France
53. Traore L, Chniti A, Hussain S, Griffon N, Darmoni SJ, Charlet J, Sadou E, Ouagne D, Lepage , Daniel C et al. "Plateforme d'interopérabilité sémantique gérant les terminologies d'interface au sein d'un territoire de santé numérique." IC 2014 75-86
2013
54. Aimé X, Charlet J "IC: Ingénierie des Connaissances ou Ingénierie du Conformisme ?" 2013 IC - 24èmes Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances Lille France
55. Richard M, Aimé X, Krebs MO, Charlet J "Au delà du DSM : les ontologies comme aide aux classifications descriptives psychiatriques ?" 2013 2e édition du Symposium sur l'Ingénierie de l'Information Médicale Lille France
2012
56. Declerck G, Baneyx A, Aimé X, Charlet J "A quoi servent les ontologies fondationnelles ?" 2012 pp. 67-82 23èmes Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC 2012) Paris France
57. Aimé X, Frédéric F, Kuntz P, Trichet F, Charlet J "Gradient de Prototypicalité Lexicale : définition et cas d'application sur la terminologie des ontologies" 2012 117-132 23es journées francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC'2012) Paris France
58. Chniti A, Albert P, Charlet J "Gestion de la cohérence des règles métier éditées à partir d'ontologies OWL" 2012 589-606 IC 2011, 22èmes Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances Chambéry France
59. Aimé X, Dhombres F, Fürst F, Kuntz-Cosperec P, Trichet F, Charlet J "Rare diseases knowledge management: the contribution of proximity measurements in OntoOrpha and OMIM" 2012 88-92 the 24th European Medical Informatics Conference (EMIC’2012) Pise Italy
60. Charlet J, Declerck G, Dhombres F, Gayet P, Miroux P, Vandenbussche PY "Construire une ontologie médicale pour la recherche d'information - problématiques terminologiques et de modélisation." IC 2012 33-48
2011
61. Declerck G, Charlet J "Ingénierie des connaissances et critique de la raison artificielle." 2011 2 Atelier Philosophie et Ingénierie. Le formel face à l'histoire, la technologie et la matérialité (IC2011) Chambéry France
62. Dhombres F, Vandenbussche PY, Rath A, Hanauer M, Olry A, Urbero B, Charlet J "Projet OrphaOnto - Première étape de l'ontologisation des bases de connaissances d'Orphanet." IC 2011 573-588
2010
63. Szulman S, Aussenac-Gilles N, Charlet J, Nazarenko A, Sardet E, Teguiak H "DAFOE: A Platform for Building Ontologies from Texts" 2010 http://ceur-ws.org/V EKAW 2010 Lisbon Portugal
64. Assele K, Mels G, Choquet R, Charlet J, Jaulent MC "Une approche ontologique pour l'exploitation de données cliniques" 2010 183-194 IC 2010 Nîmes France
65. Dhombres F, Jouannic JM, Jaulent MC, Charlet J "Choix méthodologiques pour la construction d'une ontologie de domaine en médecine prénatale." IC 2010 171-182
2009
66. Szulman S, Charlet J, Aussenac-Gilles N, Nazarenko A, Sardet E, Teguiak H "DAFOE: an Ontology Building Platform From Text or Thesauri" 2009 1-4 International Conference on Knowledge Engineering and Ontology Development (KEOD 2009) Madeira Portugal
67. Mazuel L, Charlet J "Alignement entre des ontologies de domaine et la Snomed: trois études de cas" 2009 A paraitre 20ème conférence sur l'Ingénierie des Connaissances - IC2009 Hammamett Tunisia
68. Vandenbussche PY, Charlet J "Méta-modèle général de description de ressources terminologiques et ontologiques" 2009 20:à paraître IC 2009 - 20èmes Journées Francophones d'Ingénierie des Connaissances Hammamet Tunisia
2008
69. Charlet J, Szulman S, Pierra G, Nadah N, Teguiak H, Aussenac-Gilles N, Nazarenko A "DAFOE: A Multimodel and Multimethod Platform for Building Domain Ontologies" 2008 66 Deuxièmes Journées Francophones sur les Ontologies Lyon France
2005
70. Bringay S, Barry C, Charlet J "Les annotations pour gérer les connaissances du dossier patient" 2005 73-84 IC - 16èmes Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances Nice France
71. Baneyx A, Charlet J "Construction d'ontologies médicales à partir de textes : propositions methodologiques" 2005 37-48 IC - 16èmes Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances Nice France
2004
72. Charlet J, Aït E, Bourigault D, Nazarenko A, Teulier R, Toledano B "CEDERILIC : constitution d'un livre et d'un index numériques »" 2004 187-204
73. Charlet J, Aït E, Bourigault D, Nazarenko A, Teulier R, Toledano B "Cederilic : constitution d'un livret d'un index numérique" 2004 Conférence CIDE France
2000
74. Grosz G, Tort F, Teulier R, Charlet J "Ingénierie des Besoins, Ingéerie des Connaissances : Similarité et Complémentarité des Approches de Modélisation" 2000 1 Congrès Ingénierie des Connaissances France
Publications de type "Chapitre d'ouvrage"
75. Toubiana L, Ugon A, Giavarini A, Riquier J, Charlet J, Jeunemaître X, Plouin PF, Jaulent MC "A "pivot" Model to set up Large Scale Rare Diseases Information Systems - Application to the Fibromuscular Dysplasia Registry." MIE 887-891
2012
76. Aussenac- G, Charlet J, Reynaud C "Les enjeux de l'Ingénierie des connaissances" 2012
2008
77. Léger A, Heinecke J, J.B. N, Shvaiko P, Charlet J, Hobson P, Goasdoué F "Semantic Web Take-Off in a European Industry Perspective" 2008
2007
78. Barry C, Bringay S, Charlet J "Un modèle pour les annotations du dossier patient informatisé" 2007 N/A
2005
79. Teulier R, Charlet J, Tchounikine P "L'ingénierie des connaissances: acquis et nouvelles perspectives" 2005 11-26
2004
80. Charlet J "L'ingénierie des connaissances, entre science de l'information et science de gestion" nothing 2004
Publications de type "Direction d'ouvrage, Proceedings"
2006
81. Harzallah M, Charlet J, Aussenac-Gilles N, Lewkowicz M "IC 2006 - Ingénierie des connaissances 2006 (Proceedings of the 17th French Knowledge Engineering Conference), Nantes, France, June 26-30, 2006" Actes d'IC 2006
2005
82. Teulier R, Charlet J, Tchounikine P "Ingénierie des connaissances" 2005 000
Publications de type "Autre publication"
2009
83. Szulman S, Aussenac-Gilles N, Nazarenko A, Charlet J "Projet DaFOE4App D IFFERENTIAL AND FORMAL ONTOLOGIES EDITOR FOR APPLICATIONS Dossier A.1 / Document A.1.1 Cahier des charges scientifique et technique de la plateforme DaFOE Spécifications" 2009
84. Szulman S, Aussenac-Gilles N, Nazarenko A, Charlet J "Projet DaFOE4App DIFFERENTIAL AND FORMAL ONTOLOGIES EDITOR FOR APPLICATIONS. Cahier des charges scientifique et technique de la plateforme DaFOE. Chapitre Modèle de données" 2009
Publication de type "Rapport"
2005
85. Charlet J, Jaulent MC, Slodzian M, Bourigault D, Baneyx A, Bousquet C, Mille F, Ozdowska S, Zimina M "Pertomed : Production et évaluation de ressources terminologiques et ontologiques dans le domaine de la médecine" 2005 22 pages
Publication de type "Thèse ou mémoire (encadrement d'étudiant)"
2015
86. Mahesh HB, Charlet J, Toubiana L "Development of a an ontology for vEDS Information model migrate" 2015 Mémoire de stage de Masters in Data Mining and Knowledge Management UPMC Paris 6 - 4 mois (Dir. Toubiana L & Charlet J)
Publication de type "Thèse et mémoire"
2002
87. Charlet J "L'ingénierie des connaissances : développements, résultats et perspectives pour la gestion des connaissances médicales" 2002
Publications de type "Actes congrès"
2014
88. Traore L, Chniti A, Hussain S, Griffon N, Darmoni S, Charlet J, Sadou E, Ouagne D, Lepage E, Daniel C et al. "Plateforme d'interopérabilité sémantique gérant les terminologies d'interface au sein d'un espace de partage" 2014 75-86 IC - 25èmes Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances Clermont-Ferrand France
89. Chniti A, Traore L, Hussain S, Griffon N, Darmoni SJ, Charlet J, Sadou E, Ouagne D, Lepage E, Daniel C et al. "A Semantic Interoperability Framework for Facilitating Cross-Hospital Exchanges." MIE 2014 1255
90. Chniti A, Griffon N, Traore L, Hussain S, Rodrigues JM, Darmoni SJ, Charlet J, Sadou E, Ouagne D, Lepage et al. "Terminologies et référentiels d'interopérabilité sémantique en Santé." JFIM 2014 44-58
91. Aimé X, Charlet J "Knowledge Engineering or Conformism Engineering?" WETICE 2014 399-404
2012
92. Chniti A, Albert P, Charlet J "A Loose Coupling Approach for Combining OWL Ontologies and Business Rules." RuleML 2012
93. Chniti A, Boussadi A, Degoulet P, Albert P, Charlet J "Pharmaceutical Validation of Medication Orders Using an OWL Ontology and Business Rules." SATBI+SWIM 2012
2011
94. Dhombres F, Vandenbussche PY, Rath A, Hanauer M, Olry A, Urbero B, Choquet R, Charlet J "OntoOrpha - An Ontology to Support Edition and Audit of Knowledge of Rare Diseases in ORPHANET." ICBO 2011
95. Vandenbussche PY, Dhombres F, Cormont S, Charlet J, Lepage E "Biomedical Analyses - OWL Model Based Edition." ICBO 2011
2010
96. Charlet J, Szulman S, Aussenac-Gilles N, Nazarenko A, Hernandez N, Nadah N, Sardet , Delahousse J, Téguiak HV, Baneyx A et al. "DaFOE - une plateforme pour construire des ontologies à partir de textes et de thésaurus." EGC 2010 631-632
97. Chniti A, Dehors S, Albert P, Charlet J "Authoring Business Rules Grounded in OWL Ontologies." RuleML 2010 297-304
2009
98. Szulman S, Charlet J, Aussenac-Gilles N, Nazarenko A, Sardet , Téguiak HV "DAFOE - An Ontology Building Platform - From Texts or Thesauri." KEOD 2009 372-375
99. Charlet J, Szulman S, Aussenac-Gilles N, Nazarenko A, Hernandez N, Nadah N, Sardet , Delahousse J, Téguiak HV "DaFOE - an Ontology Building Platform From Texts or Thesauri?" TIA 2009
100. Vandenbussche PY, Charlet J "ConceptTerms." WOP 2009
2007
101. Steichen O, Bozec CDL, Jaulent MC, Charlet J "Construction d'une ontologie pour la prise en charge de l'hypertension artérielle." Actes d'IC 2007 241-253
102. Steichen O, Bozec CDL, Jaulent MC, Charlet J "Building an Ontology of Hypertension Management." AIME 2007 292-296
2006
103. Léger A, Heinecke J, Nixon LJB, Shvaiko P, Charlet J, Hobson P, Goasdoué F "The Semantic Web from an Industry Perspective." Reasoning Web 2006 232-268
2005
104. Bringay S, Barry C, Charlet J "A specific tool of Annotations for the Electronic Health Record." IWAC 2005 21-30
105. Léger A, Nixon LJB, Shvaiko P, Charlet J "Semantic Web applications - Fields and Business cases. The Industry challenges the research." Industrial Applications of Semantic Web 2005 27-46
1996
106. Haouche C, Charlet J "KBS Validation - A Knowledge Acquisition Perspective." ECAI 1996 433-437
1995
107. Haouche C, Charlet J "Using a KADS Inference Structure to Test a KBS Behaviour." EUROVAV 1995 277-290
1992
108. Charlet J, Krivine JP, Reynaud C "Causal Model-Based Knowledge Acquisition Tools - Discussion of Experiments." EKAW 1992 318-336
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